Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tmco4-201ENSMUST00000043042 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Fhod1-201ENSMUST00000014922 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccdc97Q9DBT3 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms