Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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