Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Pop5Q9DB28 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms