Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn22Q9D7U6 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn22Q9D7U6 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms