Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Snx29Q9D3S3 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms