Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Snx20Q9D2Y5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms