Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm5860-201ENSMUST00000137810 1028 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Zbed3Q9D0L1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Zbed3Q9D0L1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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