Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ccdc33-210ENSMUST00000215944 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 D2hgdh-202ENSMUST00000112881 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Spocd1-201ENSMUST00000084263 3096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Dync1i2-205ENSMUST00000112139 2483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Wiz-203ENSMUST00000087703 4175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 AU022252-203ENSMUST00000141112 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Fam171a1-202ENSMUST00000072955 3364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Tcn2-202ENSMUST00000109988 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Usp10-202ENSMUST00000108988 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 AC159813.1-201ENSMUST00000222671 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Fndc7-202ENSMUST00000102620 3477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Nmd3Q99L48 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nmd3Q99L48 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nmd3Q99L48 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nmd3Q99L48 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nmd3Q99L48 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Nmd3Q99L48 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms