Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rnf144aQ925F3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms