Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ubxn4Q8VCH8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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