Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Kyat1-203ENSMUST00000113660 1388 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trappc12Q8K2L8 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms