Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Cdkl1Q8CEQ0 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms