Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm44550-201ENSMUST00000207311 2058 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Cd200r3-204ENSMUST00000114612 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm44983-201ENSMUST00000208121 463 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm32089-201ENSMUST00000221222 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Olfr1499-201ENSMUST00000055672 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trim35Q8C006 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm12361-201ENSMUST00000119806 1044 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Trim35Q8C006 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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