Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubash3bQ8BGG7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms