Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm32540-201ENSMUST00000207174 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm23062-201ENSMUST00000102349 110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm8256-202ENSMUST00000227964 828 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm14111-201ENSMUST00000119851 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Csta1-202ENSMUST00000161638 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm43103-201ENSMUST00000199021 802 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 AC140426.1-201ENSMUST00000227933 459 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 AC163646.3-201ENSMUST00000228879 772 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm5507-201ENSMUST00000091897 1008 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm8055-201ENSMUST00000099956 1008 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Tmem29-201ENSMUST00000059256 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Lrrc57-201ENSMUST00000102496 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Rps28-205ENSMUST00000173844 382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 H2-DMb2-202ENSMUST00000171231 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm3532-201ENSMUST00000181880 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm43833-201ENSMUST00000198828 293 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Ttc23-203ENSMUST00000107471 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Ifitm7-202ENSMUST00000178021 1823 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Atp5h-208ENSMUST00000180072 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 1700063D05Rik-203ENSMUST00000191461 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Cyp2b13-201ENSMUST00000005669 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm10250-201ENSMUST00000090488 482 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NischQ80TM9 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms