Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm8864-201ENSMUST00000118653 1010 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube2q1Q7TSS2 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube2q1Q7TSS2 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube2q1Q7TSS2 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm42908-201ENSMUST00000197508 870 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube2q1Q7TSS2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube2q1Q7TSS2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube2q1Q7TSS2 Gm18621-201ENSMUST00000222677 679 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube2q1Q7TSS2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ube2q1Q7TSS2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ube2q1Q7TSS2 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ube2q1Q7TSS2 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms