Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Tmeff1Q6PFE7 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms