Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Amotl1-206ENSMUST00000223132 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 9630001P10Rik-201ENSMUST00000181083 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Trp63-203ENSMUST00000115304 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1395-203ENSMUST00000214195 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Xrcc2-201ENSMUST00000030773 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Celf4-202ENSMUST00000115816 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Trip11-201ENSMUST00000021605 9873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm9866-205ENSMUST00000220998 1973 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Sft2d1Q5SSN7 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms