Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Bhlha9Q5RJB0 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms