Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Trp53i11Q4QQM4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Nrap-205ENSMUST00000167239 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms