Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gria1-204ENSMUST00000151045 5361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Zfp62-203ENSMUST00000109198 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Dock9-201ENSMUST00000040700 7803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Pcdhb11-201ENSMUST00000053073 4419 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Defa20Q45VN2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ablim1-207ENSMUST00000111529 5927 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ttll7-201ENSMUST00000037942 7394 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Stard13-202ENSMUST00000110483 5662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ctnnd1-216ENSMUST00000111690 5945 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Acaca-201ENSMUST00000020843 9026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm9271-201ENSMUST00000185988 2580 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Defa20Q45VN2 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms