Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sec31aQ3UPL0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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