Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Q3U6N9 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Q3U6N9 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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