Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sec24aQ3U2P1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms