Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm12684-201ENSMUST00000118675 999 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Slc10a1-201ENSMUST00000095572 1674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Samd11Q1RNF8 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms