Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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