Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm11715-201ENSMUST00000129501 695 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm6463-201ENSMUST00000182090 966 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 1110025M09Rik-201ENSMUST00000192082 855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Anapc15-203ENSMUST00000098237 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm2492-201ENSMUST00000221355 1394 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm24471-201ENSMUST00000104485 131 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm26913-201ENSMUST00000182391 732 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm44709-201ENSMUST00000207649 448 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 AC116797.2-203ENSMUST00000225290 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 4933424L21Rik-201ENSMUST00000142486 1186 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm37390-201ENSMUST00000192452 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm46189-201ENSMUST00000219395 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Rpl15-ps3-201ENSMUST00000088480 615 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Rab7b-201ENSMUST00000064664 1672 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Crip1-201ENSMUST00000006523 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Katnal2-211ENSMUST00000154665 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Grin2bQ01097 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms