Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gjb2Q00977 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gjb2Q00977 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms