Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Apoa1Q00623 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms