Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gfi1P70338 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Gfi1P70338 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gfi1P70338 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gfi1P70338 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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