Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Spty2d1-201ENSMUST00000061639 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SbdsP70122 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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