Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Tmod1P49813 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmod1P49813 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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