Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
PtpreP49446 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
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