Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chd1P40201 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Als2cr12-201ENSMUST00000055313 1540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Depdc1b-205ENSMUST00000171178 1404 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Igkv4-55-201ENSMUST00000103359 379 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm12338-201ENSMUST00000122170 192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ube4bos2-201ENSMUST00000154000 317 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm22009-201ENSMUST00000158792 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm34358-201ENSMUST00000204585 665 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm44659-201ENSMUST00000207269 436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Sox2ot-211ENSMUST00000197977 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pdha2-201ENSMUST00000057860 2352 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Tnni2-201ENSMUST00000105971 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm11520-201ENSMUST00000122837 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm6286-201ENSMUST00000145247 762 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm40723-201ENSMUST00000219407 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 AC093022.2-202ENSMUST00000227500 866 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Opn1mw-201ENSMUST00000033771 1227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm9583-201ENSMUST00000219613 1843 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Spz1-201ENSMUST00000050658 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 AC139845.1-201ENSMUST00000147013 1334 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm14705-201ENSMUST00000154109 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm12738-201ENSMUST00000122349 536 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 6330549D23Rik-202ENSMUST00000159536 1102 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm5397-201ENSMUST00000121081 1453 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chd1P40201 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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