Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Tmem56-207ENSMUST00000155309 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxc11P31313 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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