Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hoxa10P31310 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gfm2-208ENSMUST00000161639 3157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 A630012P03Rik-202ENSMUST00000114854 1974 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa10P31310 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms