Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Vmn1r29-201ENSMUST00000168416 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm20617-202ENSMUST00000177332 758 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm26800-201ENSMUST00000180871 349 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 AL672010.1-201ENSMUST00000215182 1246 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Tctex1d2-202ENSMUST00000080316 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr814-201ENSMUST00000081367 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm26848-201ENSMUST00000181052 2467 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Dcdc5-203ENSMUST00000126340 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm8521-201ENSMUST00000190394 606 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 CT030254.1-201ENSMUST00000225450 1078 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxa2P31245 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms