Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Abcc9-205ENSMUST00000204870 1458 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ndufa9-203ENSMUST00000205002 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Milr1-201ENSMUST00000086353 1348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm13975-201ENSMUST00000119253 782 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm9075-201ENSMUST00000168738 794 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Mir7115-201ENSMUST00000184275 64 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm17806-201ENSMUST00000195844 383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Cfap77-202ENSMUST00000157048 1042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm5710-201ENSMUST00000183020 995 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Cyp2e1-203ENSMUST00000210235 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rpl6-201ENSMUST00000031617 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Lgals9-201ENSMUST00000073001 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm10339-202ENSMUST00000181509 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm25763-201ENSMUST00000104099 129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Wfdc16-201ENSMUST00000109336 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm12452-201ENSMUST00000117128 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm14828-201ENSMUST00000119381 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm17228-201ENSMUST00000165006 491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Plut-201ENSMUST00000172461 855 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Mrgpra3-201ENSMUST00000176369 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gm37559-201ENSMUST00000193556 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Gnpnat1-202ENSMUST00000226276 710 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 CT030732.1-201ENSMUST00000226885 246 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PtprmP28828 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms