Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
RxraP28700 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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