Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tnfrsf22-204ENSMUST00000171066 1780 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Irf1P15314 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms