Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-Eb1P04230 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-Eb1P04230 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-Eb1P04230 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-Eb1P04230 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-Eb1P04230 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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H2-Eb1P04230 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
H2-Eb1P04230 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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