Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lnx1O70263 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Lnx1O70263 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms