Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Olfr1199-204ENSMUST00000213138 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Sh2d3c-201ENSMUST00000074248 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cyp51-201ENSMUST00000001507 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm3239L7N2D9 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Arhgap17-203ENSMUST00000167309 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Fmo3-201ENSMUST00000028010 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm3239L7N2D9 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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