Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20834J3QM72 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms