Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Gm28048F7BCN0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm28048F7BCN0 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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