Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lcn6A2AJB9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms