Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
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