Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Lgr5Q9Z1P4 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lgr5Q9Z1P4 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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