Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Vmn1r212-201ENSMUST00000095960 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Timm9-208ENSMUST00000221797 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Tpm3-204ENSMUST00000119570 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Pax6-207ENSMUST00000111087 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
ChmQ9QXG2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms