Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Upk3aQ9JKX8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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